——受賄罪。
1999年至2012年，薄熙來在擔任大連市人民政府市長、中共大連市委書記、遼寧省人民政府省長、商務部部長期間，接受大連國際發展有限公司總經理唐肖林、大連實德集團有限公司董事長徐明的請托，利用職務便利，在大連國際發展有限公司接收大連市駐深圳辦事處、唐肖林申請汽車進口配額、大連實德集團有限公司建設定點直升飛球項目、申報石化項目等事項上為相關單位和個人謀取利益，直接收受唐肖林給予的錢款折合人民幣110萬餘元，明知並認可其妻薄谷開來、其子薄瓜瓜收受徐明給予的財物折合人民幣1933萬餘元，共計折合人民幣2044萬餘元。
——貪污罪。
2000年，薄熙來擔任中共大連市委書記期間，安排時任大連市城鄉規劃土地局局長的王正剛具體負責大連市人民政府承擔的一項上級單位涉密場所改造工程。2002年3月工程完工後，該上級單位通知王正剛，決定向大連市人民政府撥款人民幣500萬元。王正剛遂就該款項如何處理向已調任遼寧省人民政府省長的薄熙來請示，並提議將該款留給薄熙來補貼家用。薄熙來同意，安排王正剛與薄谷開來商議轉款事宜。後該款被轉入薄谷開來指定的賬戶，由他人代為保管。
——濫用職權罪。
2011年11月13日，薄谷開來及張曉軍在重慶市南山麗景度假酒店投毒殺害英國公民尼爾·伍德。同月15日，尼爾·伍德被發現死亡。負責偵辦該案（以下稱“11·15”案件）的時任重慶市公安局副局長的郭維國等人為包庇薄谷開來，徇私枉法，使該案未被依法偵破。
2012年1月28日，時任重慶市人民政府副市長兼重慶市公安局黨委書記、局長的王立軍將薄谷開來涉嫌殺人一事告知時任中共中央政治局委員兼重慶市委書記的薄熙來，後薄熙來斥責王立軍誣陷薄谷開來並打王立軍耳光，將杯子摔碎在地上；根據薄谷開來的要求，安排時任中共重慶市委副秘書長兼市委辦公廳主任的吳文康對以提交辭職信方式揭發薄谷開來涉嫌殺人的“11·15”案件原偵查人員王智、王鵬飛進行調查，還要求重慶市公安局對王鵬飛進行審查，提議和批准取消時任渝北區副區長的王鵬飛繼續作為該職務候選人的提名；違反組織程序，主持召開中共重慶市委常委會議免去王立軍重慶市公安局黨委書記、局長職務，以此阻礙對“11·15”案件的複查。
2月6日王立軍叛逃至美國駐成都總領事館後，薄熙來縱容薄谷開來參與研究王立軍叛逃事件應對措施，同意薄谷開來提出的由醫院出具診斷證明以表明王立軍系因患精神疾病而叛逃的意見；批准重慶市有關部門對外發布了王立軍接受“休假式治療”的虛假信息。薄熙來的上述行為，是導致“11·15”案件不能依法及時查處和王立軍叛逃事件發生的重要原因，並造成特別惡劣的社會影響，致使國家和人民利益遭受重大損失。
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