農業部
6幹部違規持下屬公司股票
【問題】 所屬規劃院6名中層幹部違規持有下屬北京華農農業咨詢有限公司等3家公司股權191.98萬元，2009年至2011年從這3家公司獲取分紅、報酬、獎勵等共計231.82萬元。北京華農農業咨詢有限公司一直依托規劃院的信譽、人力等資源，從事與該院相同的農業工程咨詢業務，2009年至2011年獲取咨詢業務收入2089.67萬元。 2009年，所屬規劃院支付在編職工科技成果轉化獎263.2萬元，未按規定代扣代繳個人所得稅。
【整改】 關於違規持股的問題，相關人員已做了書面檢查，並將全額清退所持股份。
商務部
六千萬元項目未公開招標
【問題】 2011年，商務部未按規定編報項目支出政府採購預算，部分項目支出共5941.38萬元未按規定公開招標。
所屬培訓中心未經批准，以合作辦學方式出租教學樓、圖書館、學生宿舍樓等國有資產，至2011年6月已收租金2284萬元。
至2011年6月，所屬中國對外貿易中心和培訓中心負責實施的廣州琶洲展館二期工程等7個基本建設項目(投資總計30.31億元)已竣工使用3年，一直未辦理竣工決算。
所屬中國國際經濟技術交流中心將部分出國辦展業務交給民營企業承擔，並為其提供銀行賬戶。
【整改】 對此次審計發現的問題，商務部逐項提出了整改措施，部分問題已經整改到位。
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