1949年，北京的8月正是盛夏時節。為了能够在 10月 1日開國大典時升起中華人民共和國的第一面國旗，國旗圖案的遴選工作也在緊張展開。在討論國旗的座談會之前，張治中來到毛澤東住處。閑談一番後，他試探著問毛澤東：“現在大家都在議論國旗圖案，你的意見呢？”
“我同意一顆星一條黃河的那種，你覺得如何？”毛澤東徵詢張治中的意見。“我反對。中間一條杠，把紅旗劈為兩半，不成了分裂國家了嗎？”張治中直言相諫。毛澤東說：“你說的是一個嚴重問題。不過，不少人主張採用這幅，也舉出不少理由。這樣吧，我還要找些人座談一下，你也來。”張治中欣然同意。政協一屆會議開幕前，座談會在中南海舉行。
張治中說：“第一，杠子向來不代表河流，中間一橫杠容易被認為分裂國家，分裂革命；第二，杠子在中國人的傳統觀念中是金箍棒，國旗當中擺根金箍棒幹嗎？不如用這一幅五星紅旗。”張治中的話得到大多數人同意，毛澤東也覺得有道理，於是表示傾向張治中的意見。毛澤東的虛心納諫，敢於否定自己原來的意見，使張治中十分欽佩。後來，他在一次講話中說到這件事時，還十分動情。國旗審閱小組以比較一致的意見確定了五星紅旗為國旗，也就是今天一直高高飄揚的國旗。
1954年，全國人大一屆一次會議快要開幕，毛澤東原不準備講話。但是經過張治中的再三勸說，最後，毛澤東還是作了題為《為建設一個偉大的社會主義國家而奮鬥》的講話。講話扼要、精辟，“領全面、其中最重要的兩句：導我們事業的核心力量是中國共產黨，指導我們思想的理論基礎是馬克思列寧主義。”指明了我國政權建設和黨的思想建設的基本原則，尤其受到全體代表、全黨、全國人民的熱烈歡迎。
全國人大一屆一次常委會開過後，張治中緊接著建議：人大常委會委員應該每年外出視察，了解地方情況，聽取群眾意見。毛澤東馬上表示贊同，並且加以擴大，把全國人大代表和全國政協委員都加進去。以後，參觀視察就形成一種制度，一直沿用至今，而且越來越完善。
有一次，在會議休息室裡，有人談起視察的事，講到這件事是由張治中建議才實行時， 張說，建議視察的範圍經過主席擴大了。毛澤東隨即用幽默的語調說：“他這個人專做好事，做了許多好事！”
在參加討論憲法草案時，張治中認為草案總綱第四條中有“台灣地區除外”的字樣，應予删除，因為台灣問題是暫時的，而憲法是永久的，大可不必在憲法上面這樣寫出。毛澤東十分贊成，大家一致同意删去。
中華人民共和國成立後，張治中任西北軍政委員會副主席，全國人民代表大會常務委員會副委員長等職。1954年9月、1959年和1965年，張治中分別任第一、二、三屆國防委員會副主席。1955年9月因張治中已不在人民解放軍中任職，未被授予軍銜，但考慮他在人民解放戰爭中的功績，被毛澤東授予一級解放勛章。
由於他的努力，促成了新疆的和平解放，他還非常關心台灣回歸祖國問題，對增進民族團結、促進國家統一和祖國的社會主義建設，做出了重要的貢獻。1969年4月6日在北京病逝。
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