在福利方面，像是給予台商子女在平潭可享受免費教育，在平潭就業、居住的台胞可參加當地養老、醫療等社會保險等方面享受特殊待遇；未來2020年台灣地區機動車可自由進出平潭等投資配套。
在金融方面，將在平潭島上實行“雙幣制”，允許平潭的銀行機構和台灣地區銀行之間開立人民幣同業往來的帳戶和新台幣同業往來的帳戶，允許平潭符合條件的銀行機構為境內外企業以及個人開人民幣的帳戶和新台幣的帳戶。
在人才方面，將承認台灣證照，同時福建省決定要建設平潭人才特區，實施“四個一千”的人才工程，使平潭島成為兩岸人才交流的先行區，也是各類優秀人才的聚集區。
在管理方面，為了讓台灣同胞參與管理平潭，平潭實驗區將延攬1位副主任（相當於副市長級）、4位副局長，加上15名國有企業單位的高級職位，副主任年薪達1000萬元新台幣，並提供3年免租金公共租賃房，就職者服務滿3年可購置1套限價商品房。雖然對於平潭管委會招聘副主任及管理人員，因為按照“兩岸人民關係條例”，台灣人民若前往大陸擔任公職將處以10萬至50萬元新台幣罰款，而衍生爭議。
在稅制方面，台商企業所得稅減少15%的徵收、個人所得稅按大陸與台灣的差額由福建省政府補貼、支持台灣金融機構在平潭設立經營機構、允許辦理新台幣現鈔兌換業務等“特殊政策”。
但必須注意的是，目前平潭開發之具體內容和配套措施，尚未具體，其產業支援系統也還不完整，對台商之投資，仍存在相當大風險。2012年底，福建高層率團來台，特別和在平潭投資的大型台商公司座談，不對外開放的會議中，這幾家大公司的主管對平潭特區進展頗有意見。會中普遍認為平潭要作為台商進入大陸的第一站，或吸引台資設置企業總部，但在人才培育、土地取得、配套措施等規定上都仍有進步空間，若再加上許多限制，將會讓台商打退堂鼓。這也是台灣“經建會”的顧慮所在，也是讓台商保持觀望的主因。因此大陸除了政策支持平潭之外，還需要不斷創造“獨特”的優惠來吸引台商前來平潭投資。
四、平潭試驗區內應如何突破
1.打造合理物價水平
自平潭試驗區推出規畫開始，其試驗區地價開始上揚，但大多淪為投資客短期操作手段，房產上揚嚴重影響到平潭物價水準。目前平潭不管在食、衣、住、行、育、樂方面遠沒有廈門便捷，但其物價水平已有超過廈門之跡象，台商要在平潭生存，其門檻相當高，台商投資意願自然低落。
平潭目前房產每平方米在10，000人民幣以上，而且持續快速增加中，甚至誇張到22，000元，辦公室租金也達到每平方米50元人民幣起跳的水準，這個價格在廈門島內外，一樣可以取得土地與租得店鋪，且基礎建設及配套都比平潭好太多。因此，平潭在規劃時，應規劃出合理價格土地，讓建商蓋台灣社區，只准許台灣人購買，將房價限制在3，000～4，000人民幣之間。但規定台灣人購房後5年內不可轉賣，這樣措施肯定可以吸引台灣人前往。
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