高育仁建議，兩岸簽署和平協議之後，兩岸官方可以互派代表常駐對方，此時兩岸就會進一步處理最棘手的“主權”問題。他認為，30年到50年的期間，可以說是兩岸的過渡期，用時間來探討解決兩岸關係的最終模式，不論是聯邦、邦聯、國協，或有一套中國人特有的模式，兩岸簽訂基本的憲章。
高育仁指出，兩岸應該以過去一百年的歷史做基礎，來解決問題。兩岸雙方應該冷靜、理性地面對百年來的歷史，根據事實來看待問題，國民黨政府在大陸統治時，不能否定共產黨的存在。相反地，共產黨成立中華人民共和國之後，也不能否定“中華民國”在台灣的存在，在這樣的前提下，大家謀求和平發展、簽署和平協議，經過一段時間後，達到最後解決的模式。
高育仁說，對於兩岸的最終模式，他相信兩岸這一代的年輕人會有智慧，不一定會延用原有政治理論的模式，而會是中國特有的模式。 |
