最初“公民投票法”通過之時，恰是藍綠惡鬥中最為激烈的時刻之一，該法案的通過過程充滿了各種算計與妥協。民進黨一開始竭力推動“公投法修正”，主要是出於實現“台獨”的需要、與國民黨鬥爭的需要、以及落實直接民主的需要。對於台灣2003年版的“公投法”，以民進黨為代表的綠營勢力是極為不滿的，是強烈反對的，認為公投門檻太高、限制太多，而被稱之為“鳥籠公投”，極力主張通過“公投法修正”，以降低公投門檻，真正落實直接民主。對於這一點，我們也不應完全抹殺；否則，也不客觀。至2016年12月15日，民進黨團初審“公投法”部分條文修正草案版本時，因“領土變更案之複決”與“兩岸政治協議應先交付公投”兩項條文會觸及兩岸敏感神經，綠營“立委”已自行將其删除。民進黨從“公投法修正”的積極“推動者”到部分議題的“刹車者”，其角色的轉換不是為了停止“公投法修正”，而是策略的運用，擔心某些敏感“主權”議題會引發大陸的反彈，這是其走務實、漸進“台獨”路綫的體現。
國民黨在“公投法修正”問題上的態度，前後表現得很不相同。因為“公投法修正”意味著改變過去國民黨版本的“公投法”，在某種意義上是對國民黨的否定，所以國民黨一般會反對。不過，這只是一般性分析。因為國民黨也是一個變化的政黨，且其內部派系林立。隨著國民黨自身、台灣政局以及島內社會政治生態的變化，目前國民黨在島內的力量狀況及兩岸路綫已經發生了很大變化。所以，國民黨對於修改“公投法”的態度，也經歷由反對到配合甚至積極推動的變化。這裡面有國民黨需要借助修改“公投法”來改善自己處境的需要，也有國民黨對“一個中國”原則堅守的鬆動。
國民黨團在初審“公投法”修正案時一度“放水”，其實這開啓了一個非常惡劣的先例，也反映出國民黨和台灣社會生態的變化，這正是令大陸焦慮的地方。國民黨逐步向“中間路綫”靠攏，不再像以前一樣抵制民進黨修改“公投法”，甚至有所主動配合。在這種情況下，完成“公投法修正”就水到渠成。
從某種意義上說，“公投法修正”之所以在台灣能够順利得以推動，既是藍綠兩大陣營相互靠攏的表現，也是相互靠攏的結果。往更深層次說，國民黨之所以要向中間路綫靠攏，一是為了選舉的需要，它必須順應這一趨勢；二是國民黨“一個中國”立場的漸趨鬆動。而民進黨之所以向中間路綫靠攏，是因為原來的“激進法理台獨”或極端“台獨”路綫已經行之不通，而迫使其走上了務實、漸進“台獨”的路綫。藍綠相互靠攏、凝聚共識，其折射出來的深層變化，更是引起大陸的高度關切。在“修憲”和“修法”問題上不斷合作，且不斷迎合所謂“台灣主流民意”。對於大陸來說，最大的挑戰在於，過去“依國民黨牽制民進黨搞‘台獨’”，但在兩黨不斷相互靠攏的趨勢下，大陸反對“台獨”的抓手將不再像以前那麼運用自如。這對大陸來說，是一個挑戰。
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