審計發現，有的地方政府一邊借新債還舊債，一邊有大量的存量資金趴在賬戶上睡覺。
2013年，審計署重點審計的32個中央部門結存資金半數閑置超過1年。至2013年年底，這些部門結存資金974.20億元中，有493.80億元（占50.69%）是2012年底前形成的，結轉超過5年的有8.36億元。
2013年重點審計的9個省本級和9個市本級財政存量資金，近三成已無法按原用途使用。至2014年3月底，這些地方財政存量資金共計7673億元，其中有指定用途的4802億元（占62.58%），主要集中在城鄉社區事務、農林水和環境保護等政府投入不足領域。
此外，中央財政對創業投資基金的投入閑置較多。批准設立的141個基金中，39個未按時成立，加之部分已成立基金參股方未足額出資，導致財政投入23.22億元滯留在托管賬戶。由於業務開展慢，已成立基金籌集的資金中，有127.75億元結存未用。
審計署有關負責人說，目前財政資金使用中有幾對矛盾，一個是地方財政存量資金較多，舉債規模也較大；另一個是，民生領域資金投入不足，卻將財政資金投入競爭性領域。
審計署已經向中央建議，盡快出台財政存量資金管理辦法，對確屬沒有指定用途或因政策變化無需繼續執行的存量資金，應盡快清理，統籌安排使用。同時加強政府性債務管理，嚴格限定債務資金投向，適度加大棚戶區改造、保障房建設、城市地下管網建設改造等方面的政府性債務資金投入。
78.29億元保障房建設資金被挪用
除了每年對中央部門預算進行常規審計外，審計署每年都會對一些專項領域的資金進行審計，2013年的專項審計有保障房、扶貧資金、礦產資源開發利用及相關資金征管、重要儲備物資等。
礦產資源開發審計中發現較多的問題是，國土資源部門違規審批和礦業權轉讓中的不當得利。抽查的3724宗礦業權中，國土資源部門越權審批或違規審批不符合條件的礦業權636宗，有114宗存在低價出（轉）讓和溢價收購從中牟取不當利益的問題，還有13宗在國有企業改制時被無償轉讓。
如在陝西省靖邊縣3宗探礦權出讓中，國土資源部門有關工作人員違規審批，民營企業5年間通過轉讓部分股權方式將探礦權轉手倒賣獲取暴利。
2013年，各級財政安排保障性安居工程資金4000億元，審計發現，有38個單位騙取套取棚戶區改造資金15.41億元，有237個項目或單位將78.29億元挪用於市政設施、園區開發等。
河南新鄉投資集團有限公司通過編造虛假棚戶區改造規劃、虛估投資額等，以城市棚戶區改造名義發行債券9億元，其中7.77億元實際用於旅遊開發、對外出借和投資等。
結合國有企業審計，2013年，審計署還重點調查了煤炭、棉花、玉米等重要物資儲備情況，發現一些戰略物資儲備不足，有的進口儲備物資質量控制不到位。
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