更具體來說，針對“經濟部”部分，相關因應措施包括根據產業與勞工所受之各種可能影響，依對象不同而分別採行不同的調整支援策略：對於內需型、競爭力較弱、易受貿易自由化影響之產業，主動予以振興輔導；對於進口已經增加，但尚未受損之衝擊產業，主動協助體質調整；對於已經受損之產業、企業、勞工，提供損害救濟，同時協助台灣中小企業突破現有經營模式，以厚植競爭實力。針對“勞委會” 部分，相關因應措施包括對於可能受到影響產業的勞工，已規劃“因應貿易自由化勞工就業發展與協助方案”將投入365億元，協助勞工就業安定及提供轉業再就業相關協助措施。
簡言之，馬政府的策略及目標，就是ECFA是“一幫二不三要”，“一幫”就是幫助人民做生意，提升台灣競爭力；“二不”是不開放大陸勞工來台，不增加大陸農產品進口。“三要”是要關稅減免、要投資保障、要保護智慧財產權。當然這樣的策略，大陸方面也一定會有不同的看法，但這就需要兩岸不斷地溝通，也就是大陸對台“讓利說”的具體善意展現。
至於外界最為關心的問題，ECFA能增加多少就業機會？衝擊多少勞工？根據“經濟部”委託中華經濟研究院針對洽簽兩岸經濟協議對台灣就業的影響，研究顯示，以台灣目前約1，010萬的總就業人數為基礎，一旦簽署兩岸經濟協議，可望再增加就業人數25萬7000人至26萬3000人；而“勞委會” 委託的研究，也顯示簽署兩岸經濟協議，台灣總體就業人數可望增加約10萬5000人至12萬5000人。
反之，如果不簽兩岸經濟協議，當東協與中國大陸等國陸續簽署區域貿易協定，而台灣被排除在外時，台灣經濟會萎縮，實質GDP將會下降0.179%，就業人數減少。從職業類別來看，低階技術工、商品買賣業之服務佐理人員及操作工、體力工都會受到衝擊。根據“勞委會” 曾綜合“經濟部”和“勞委會” 各自委託的研究，取最大影響的預估值，評估預計有八萬人會因為兩岸經濟協議的簽訂而受到影響。但是，所謂八萬人受影響，絕不盡然是指八萬人會失業，因為所謂“受影響”可能是指雇主訂單減少，以致薪資降低、工時減少或福利縮水等。
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