不過，印尼和美國的關係其實不止只有反恐。印尼的17000個島嶼覆蓋了一些對世界戰略極為重要的航道，即是馬六甲海峽，巽他海峽和龍目島。每年，全球近一半商船和東北亞大部分能源供應都要航經這些海峽。另外，這些海峽也是全球海盜虎視眈眈的目標。對美國而言，保衛印尼的海峽安全及貨品運輸順利是很重要的戰略目的。
近年來，東南亞國家都將焦點集中在中國日益頻密的地區活動上。中國急速發展的海軍現代化和其南海“野心”息息相關。文章指出，南海和周邊地區估計蘊藏著28億桶石油，所以只要獲得這些小島的控制權，該國的戰略實力將獲大大加強。因此，中國、越南、菲律賓、馬來西亞和文萊都積極爭奪南海主權，結果挑起一些衝突，包括最近的中菲黃岩島事件。
文章表示，中國增加軍事存在，理所當然會使鄰國感到不安。出於對中國的恐懼，越南和菲律賓等東南亞國家都投向美國懷抱，然而印尼是個例外。除了在婆羅洲附近一個小小的納土納群島，印尼與中國很少出現土地重疊紛爭，所以印尼和中國解放軍海軍不大發生任何衝突。
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