黃偉峰分析，美方極不願意將經貿事務擴大到台美安全合作。台美安全合作，不但保證台灣本身安全，也是維繫東亞區域和平與穩定，因此台美之間軍事、安全交流，應不會受到影響，這也是馬政府之所以敢判斷軍事上合作影響不大的原因。
黃偉峰指出，台灣用書面立法，違背台美雙方書面簽訂的協議，對美國來說面子掛不住，至於馬政府希望組團到美國溝通，這根本是緣木求魚。若台灣立法違反台北議定書內容，而美國又可以接受溝通團的遊說，那之後其他國家與美國簽訂經貿協定，若反悔是否比照辦理？美方一定不希望開這個先例。
黃偉峰也說，若美方將此次美牛問題，歸為單純經貿問題，首先TIFA就會受到衝擊。但他透露，其實TIFA一直是美國想要的談判，台灣想要的是自由貿易協定(FTA)，但美國因國內原本反FTA因素，加上在中國大陸的美商公司，強力希望美方不要處理美台FTA。
這種情況下，台灣只能順從美方要求先從TIFA開始談，但TIFA等於是將FTA分成好幾章去談。如果是包裹談判，台灣還有討價還價的空間，但若分章去談，因台灣國力小，最後只能百分之百符合美國要求，才能繼續談下去。長期來看，台灣市場因為開放，而使產業更有競爭力，但短期則對弱勢產業，以及政治利益傷害很大。
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