資料表明：台日經濟海域問題，根源為1996年日本依聯合國海洋法，單方面制定“有關專屬經濟海域及大陸礁層法”，從最南端的與那國島劃200海里經濟海域，把台灣、馬祖都劃到其經濟海域。依照這樣的劃法，台灣如果從釣魚島列嶼劃200海里經濟海域，日本的琉球也會整個被劃進來。由於日本的劃法不合理，台灣和日本曾進行談判，日本政府雖讓步，但仍堅持中線原則處理，但此舉造成海域面積就在蘇澳外海，漁船只要從蘇澳出海，一個多小時就到日本經濟海域。
因此，台灣在1998年實施“‘中華民國專屬經濟海域及大陸礁層法”，因為中線原則對台較不利，因此主張衡平原則，由雙方協商解決經濟海域問題。從1996年至今，台、日進行過16次漁業談判，但一直無法達成共識。
媒體報道說，日本擅自擴張經濟海域後，其海上巡邏艦長期掛著寫有“此地是日本的領海要立即退出”的白帶警告標語，不時執行驅離漁船任務；台灣漁船不論是捕漁、船只擱淺，還是救難船，都會遭查扣船並罰錢。有時一些無辜的台灣漁船因潮流不慎網具漂進日本經濟海域，就被當成賊，連人帶船一起扣押，罰款430萬日圓，約130萬台幣，不久前又提高為一千萬元日圓，一年所得也不夠罰款，致使漁民恐懼感更深。
前述這麼棘手的問題，顯示出所謂的台日漁權問題，其實是無解的難題。日本不可能會退卻，除非台灣先向日本低頭，承認日本的單方面制定“有關專屬經濟海域及大陸礁層法”，讓台灣漁民處在更加艱難的狀態。如果台灣不會這樣做，我們看不到什麼樂觀的層面。
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