於是，俞新天帶領大家制定出一個科研津貼計劃，給科研骨幹一年發兩萬五千圓的獎金，這在當時是一件很了不起的事。三位所領導帶頭不拿津貼，只拿每月數百元的獎金。這樣堅持了5年，改革阻力也減少了不少。同時，俞新天也對整個研究人員的獎勵晉升機制進行了改革，為每一級的研究人員制定不同的發展目標，同時增加相應的獎金。把所有的評判標準公布出來，讓每個人都看到自己奮鬥前行的目標，公開公平公正地進行評估。這樣一來，不僅減少了改革的阻力，而且也很有激勵作用，大家開始不斷往上升，再也沒有時間內耗。
一系列舉措推出後，上海國際問題研究院迎來了復興的春天。第一年，很少對外表揚的外交部給他們發來了感謝信。第二年，國台辦給他們發來了感謝信，後來中央黨校等機構也都一一給他們發來了感謝信。
推動智庫高層會談 榮獲偉大領袖新月獎
在上海國際問題研究院擔任黨組書記兼院長時，俞新天還提出了智庫應最大限度發揮對話溝通的作用，進行更多的高層會談，尤其是與不了解我們甚至反對我們的右翼保守智庫對話，以便對我們國家的外交政策起到更大的作用。在俞新天的帶領下，研究院重點做高層智庫的工作，建立了與美國傳統基金會、企業研究所和日本岡崎研究所等保守派對話的機制，為我國對美、日和亞太政策提出了不少新鮮有益的建議。俞新天極其重視我周邊國家，率領院代表團遍訪中亞國家、南亞國家和東南亞國家，為上海合作組織的建立、為中國與東盟合作機制做出了貢獻，屢受中央和外交部的表揚。2005年，上合組織峰會在上海舉行，巴基斯坦總統穆沙拉夫接受了他們的邀請，來上海國際問題研究院演講，俞新天組織了上海各大院校的知識菁英來參加。在宴請穆沙拉夫總統的餐會上，大家接著討論問題，輪流發言，提供想法給穆沙拉夫。穆沙拉夫也都做了回應，看得出很滿意。這是穆沙拉夫訪華唯一全部以英語對話的交流。據說，他回去後，巴基斯坦國家電視台將他在上海國際問題研究院的演講和互動情況整整播放了一週。
半年後，俞新天收到了巴基斯坦駐華大使的信件，說要提名授予她偉大領袖新月獎，這是給文職人員的最高獎項。同時，還邀請俞新天下次作為穆沙拉夫總統的客人訪問巴基斯坦。第二年，俞新天到北京領取了這個獎。在上海國際問題研究院慶祝50週年時，她將這個獎捐贈給了研究院。她說，這個獎雖然是表彰我，但其實是給我們院的，因為我們院全體同仁做了大量的工作。
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