近年來的國際武裝衝突表明，持續高強度作戰，巡航導彈往往不夠打，而能夠大量使用的廉價制導彈藥作用十分明顯。可見，儘管B-21可攜帶遠程巡航導彈，但它主要使用場景是依靠自身隱身能力，穿透對方防空系統，然後大量投放制導彈藥。美空軍B-2轟炸機就是採取這種模式作戰。
據報導，在高強度作戰中，面對擁有先進防空系統的對手，B-21會在其他力量配合下作戰。例如，首先使用巡航導彈、高超音速導彈等防區外武器對對方重要指揮節點、大型反隱身雷達實施打擊，同時，對對方防空系統進行高強度電子干擾，再配合防空壓制體系，然後派出B-21實施高強度打擊。此外，B-21未來也能實施反水面作戰，遠程反艦導彈是備選武器。
謀求實現“極低可探測性”
美空軍官員將B-21相關設計描述為“極低可探測性”，而不是描述F-22和F-35戰鬥機的“非常低可探測性”。奧斯汀表示，即使世界上最先進的防空系統也很難探測到B-21。不過，他說的是“很難”，而不是無法，而且表述的是防空系統，而不是雷達。因為防空系統的制導雷達探測距離相對較近。
目前很多雷達具備探測隱身目標的能力。美國“薩德”反導系統和“宙斯盾”系統配備的雷達，均可探測到160公里外高爾夫球大小的目標。採用先進有源相控陣技術的SPY-6雷達，靈敏度更高，能夠在更遠距離探測到隱身目標。此外，天波超視距雷達、無源雷達、外輻射雷達等反隱身雷達，也能在更遠距離探測B-21這類目標。
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