2007年3月23日至27日，日本人佐藤正光、水上和則攜帶兩部手持GPS接收機，1∶25萬、1∶50萬比例尺英文版地形圖光盤、筆記本電腦等，以考古研究名義在江西省南豐、鷹潭、上饒、鉛山等地，擅自實施測繪竊密活動。江西省國家安全機關聯合測繪部門對其審查，發現他們采集的坐標點位數據中有2個絕密級、4個機密級、1個秘密級軍事秘密，對我軍事設施安全構成嚴重威脅。
2008年，日本諜報分子因窺測和拍攝中國河北某軍事設施被逮捕。2010年2月20日，某日本公民攜帶手持GPS接收機在塔城地區進行測繪活動時被發現，其采集的地理坐標信息共598個，其中588個位於新疆維吾爾自治區內，涉及塔城地區軍事管理區的有85個。
另據報道，2015年5月，一名日本男子因為闖入浙江東部的一處軍事設施內被捕。同年，一名頻繁出現在中朝邊境地區的日本籍男子引起中國安全部門的注意，他在接受審訊時承認，自己的使命與日本政府有關。
由於採取各種方式掩飾間諜活動，有的日本間諜對中國的竊密活動甚至長達數十年之久。如日台經濟人協會理事長阿尾博政，他以經濟學學者的身份潛入中國，從1982年開始，為日本陸上幕僚監部呈報了150篇關於中國情況的報告。2009年，他還在日本出書講述自己的間諜經歷。
另如2016年7月因涉嫌從事間諜活動在中國被捕的日本日中青年交流協會理事長鈴木英司。1983年8月14日，鈴木英司受中華青年聯合會的邀請訪華。在這之後的33年間，訪問中國約150次。鈴木英司於2016年4月獲邀擔任日本眾議院調查局客座調查員一職，負責中國局勢和朝鮮問題的調查分析，並於同年5月在眾議院調查局發表了題為“中國的外交”的演講。
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