此前，楊效曾對於如何從海量NGS數據中準確鑒定植物miRNA進行了系統研究並開發出了效果顯著的方法——miRDP系列工具（miRDeep－P和miRDeep－P2），該系列方法已經成為國際上鑒定和分析植物miRNA的標準方法。2018年底，楊效曾又對原有方法進行了系統升級，升級後的新方法在解析大基因組和複雜基因組植物（如小麥）的miRNA鑒定和注釋方面得到了全面提升，在提高預測敏感度和精度的同時，極大地降低了運算時間，優勢顯著，該系列相關成果曾發表在國際生物信息學的頂級雜誌《Bioinformatics》上。在楊效曾的帶領下，國內外團隊還對玉米根蟲中的miRNA進行了系統的挖掘和鑒定，並比較了動物中尤其是昆蟲中miRNA的演化，該工作為利用miRNA作為RNA干擾的載體開發新抗蟲技術奠定了基礎，相關成果已經被基因組學的頂級雜誌《Genomics， Proteomics ＆ Bioinformatics》接收。
（來源：科技日報） |
