2015年6月，程曉健升任西部戰區空軍副參謀長，躋身副軍級。2016年5月，她晉升空軍少將軍銜，成為繼劉彌群（2001年晉升）、岳喜翠（2003年晉升）、劉曉連（2004年晉升）後，人民空軍歷史上第四位女少將。
新華社曾報道，2005年中俄聯合軍演時，程曉健作為中方空軍代表和中方四機編隊的第二架飛機機長，參加了這次演習。此時，她已飛過伊爾－12、伊爾－14、安－26、運－7、伊爾－76等6種機型。
其間還發生了一個小插曲：在中俄空軍飛行合練任務完成後，俄軍飛行團長專程找到程曉健說：“你飛過的弧線和你人一樣漂亮。就是你的名字太難叫了。”程曉健則回答說：我的俄文名字叫“娜達莎”。
新京報記者注意到，在多次搶險救災中，都能看到程曉健的身影。
1998年洪水時，湖北公安數萬群眾被洪水圍困，時任航空兵某團副團長的程曉健，負責指揮運輸機飛赴抗洪一線。
在2008年汶川地震救災中，時任駐蓉運輸航空兵某師副師長的程曉健，擔任了空軍抗震救災指揮中心的協調員，負責在太平寺機場指揮部協調、指揮、分配空軍大型運輸機的抗震救災任務。從5月14日到6月24日，程曉健整整奮戰了42天。她指揮的空軍救援部隊接連成功實施盲投，創造了很多世界空投史上的“第一次”。
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