國家安全委員會的成立將徹底改變這種局面。國家安全委員會既是一個決策機構，同時也是一個協調機構；既是一個綜合性的權力機構，同時也是一個解決具體問題的最高權力機構。國家安全委員會可能由國家主席、副主席、國務院總理、全國人大常委會委員長、政協主席和中央政治局常委以及中央部委的負責人組成。國家安全委員會可以針對國內外重大的事項直接作出決策，也可以充分協調國家權力機關及時處理具體的國際國內糾紛；國家安全委員會是國家權力機構的重要環節，國家安全委員會的職責決定了，它必須凌駕於其他國家權力機關之上，成為一個超級的最高決策機構。可以這樣說，國家安全委員會將會把國家主席這個名義上的元首變成一個擁有絕對權力的國家領導人，中國共產黨總書記可以通過國家安全委員會充分貫徹自己的意志，可以通過國家安全委員會統轄國家行政機關、司法機關和軍事機關。曾經有學者認為，中國的國家安全委員會相當於中央政法委員會，這是不了解國家安全委員會的職責所產生的錯覺。國家安全委員會實際上是國家的最高決策機關，國家安全委員會通過的重大決議，必然要通過國家的最高行政機關、最高軍事機關和最高司法機關貫徹落實。國家安全委員會的設立不僅解決了中國共產黨總書記直接領導國家權力機關的通道問題，而且解決了國家政權機關之間的協調問題。
國家安全委員會不是一個咨詢機構，而是一個決策機構；國家安全委員會也不是一個單純的議事機構，而是一個戰略規劃執行機構。國家安全委員會將會針對國家安全體制中存在的問題，提出一系列解決問題的建議，由全國人大通過相關立法，並且由國務院和軍事委員會貫徹落實。國家安全委員會將會針對中國發展的安全問題提出重大安全戰略方針政策，然後由全國人大、全國政協、國務院、中央軍事委員會和司法機關協調執行。可以這樣說，國家安全委員會將會成為一個決定中國命運的最高決策機關。雖然從表面上來看，國家安全委員會作出的各項重大決策都必須由全國人大及其常委會制定為國家的法律，並且由國務院貫徹落實，但是從本質上來說，由於中國共產黨總書記以及中國共產黨政治局的成員可以依照法律的規定直接進入國家安全委員會，這就使得中國共產黨可以充分利用國家安全委員會這個平台，發揮更大的領導作用。
國家安全委員會設立標誌著中國的憲政體制發生重大變化，中國共產黨在國家政權體制的領導力將會進一步加強，整個國家的政權結構將會更加完善，中國國家主席將會從名義上的國家元首變為國家的最高決策者。
此前，中國共產黨為了更好地領導國家權力機關，在中國共產黨組織內部設立了各種類型的領導小組，這些領導小組通過跨部門的協調工作，確保國家機器正常運轉。事實證明，領導小組制度對於執政黨履行自己的職責起到了關鍵性的作用。正因為如此，第十八屆三中全會決定成立全面深化改革領導小組，在中國共產黨體制內部組建負責改革總體設計、統籌協調、整體推進、督促落實的組織機構。中國共產黨之所以設立國家安全委員會而不是中國共產黨內部的國家安全領導小組，根本原因就在於，國家安全領導小組只能在中國共產黨體制之內發揮作用，而國家安全委員會作為國家的權力機關則可以直接統轄國家政權機關。中國共產黨的總書記是國家主席，負責召集國家安全委員會，在中國共產黨政治局之外，針對國家所面臨的安全問題作出重大決策。這樣做不僅可以實現國家安全決策與執行的直接對接，在第一時間對國家重大安全問題作出反應，而且可以充分發揮中國共產黨總書記的作用，貫徹落實中國共產黨的各項方針政策。可以設想，今後國家安全委員會可以統一協調國家行政機關、國家立法機關，國家司法機關和國家軍事機關，制定更加全面的對外方針政策，及時化解國內出現的安全矛盾，最大限度地保護國家的安全。
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