林益世在同日則發表聲明，認為自己身陷政治謀殺，民進黨“立委”趙天麟則宣稱聽過林益世與業者間對話的錄音帶，林益世表明願主動到特偵組配合調查，晚間林益世還主動叩應到電視台政論節目，要求握有證據者將資料交給檢方偵辦，“讓我一刀斃命”。
至於另一當事人陳啟祥在爆料後卻行蹤不明，特偵組在6月30日凌晨拘提陳啟祥並傳喚陳的女性友人到案，經過一整天訊問後，陳啟祥將手中證據交給特偵組，並交出兩份關鍵錄音帶，特偵組因此將兩人請回，不過陳啟祥遭限制出境、住居。
特偵組在掌握林益世收賄相關事證後，檢方在7月1日檢方分11路搜索林益世位於台北、高雄的住所及多家公司，並在1日下午4時傳喚林益世、彭愛佳夫婦到案說明，彭愛佳在經過2小時偵訊後先離開特偵組，當時她還表示“百分之百相信丈夫林益世”，還希望特偵組盡快釐清真相，還給林益世清白。
林益世在經過12小時訊問後，終於坦承部分犯行，7月2日凌晨4時10分，檢方依涉貪污罪嫌重大，有串證、滅證之虞，向台北地院聲請羈押禁見，林益世透過委任律師賴素如坦承做錯事情，並表示對自己的行為不當已有悔悟，賴素如則是在臉書上發文，稱自己看到相關罪證也十分詫異。
馬英九在得知林益世認罪之後，2日上午則是首度對本案道歉，同時也要求執政團隊未來在用人時必須更謹慎小心，陳冲隨後也召開記者會致歉，林益世稍後則是發布道歉聲明，並表示會將不法所得全數繳回，未來並將投身公益，北院在召開羈押庭後，2日晚間裁定羈押禁見2個月。 |
