不過在阿富汗境內，仍有美軍駐扎，2009年初人數為1.4萬人。2003年10月，持久自由反恐行動在聯合國安理會1510號決議的基礎上取得合法性。美軍在阿富汗有司令部，一直在進行積極的軍事行動。除此之外，在阿富汗還活動著國際安全援助部隊。2001年12月20日，聯合國安理會通過的1386號決議，在此基礎上創建的國際安全援助部隊旨在保障阿富汗過渡政府在喀布爾及其郊區的安全。聯合國安理會通過的1386號和1510號決議使美國軍隊在阿富汗境內的活動獲得合法性，這也可以被看作是美國取得的成功。
美國政府最大的失敗是美國在阿富汗推行的新戰略破產，該戰略是美國總統奧巴馬在2009年12月1日提出的。根據這一戰略，美國將在阿富汗增加3萬美軍，延期駐扎半年，以解放塔利班控制下的阿富汗部分地區並確立起卡爾扎伊政府對當地的統治。
美國並沒有加強阿富汗的國家軍事力量。塔利班完全地保住了武裝力量，並順利地轉入游擊戰。應該將2010年6月國際安全援助部隊與美軍駐阿部隊司令麥克里斯特爾將軍的辭職看作是美國對阿富汗新戰略的失敗。美軍及其盟友的戰爭損耗在不斷增加，個別地方包括早前相當平靜的北方地區都周期性地處於塔利班的控制之下。
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