根據設計要求，日本的核電站的核電機組必須在運營13個月之後徹底停止，進行定期的檢修。在福島核電站事故之後，按計劃進行定期檢修的各個核電機組都沒有恢復運營。包括九州電力公司的玄海核電站2、3號機組，關西電力公司的高浜核電站1號機組，美浜核電站1號機組，北陸電力公司的志賀核電站1號機組共5個機組，在原定的檢修後恢復運營的3個月之後還沒有重新啟動。這些核電機組之所以沒有重新啟動恢復運營，主要是核電站周邊居民的強烈反對。而5月10日菅首相要求中部電力公司停止核電機組運營的舉動更是強烈聲援了這些反對核電站的居民。反對核電站的聲浪更加高漲，不僅上述這些核電機組無法按計劃恢復運營，而且日本其他核電站也都將被迫停止運營。那麼在13個月之後，日本國內的所有核電站就都會被迫停止運營，而日本全國也將因此失去近30%的電力。
同時這也意味著在3月份那次大震災中沒有受到影響的日本西部地區也將受到嚴重影響。因為地處日本西部的關西電力公司、九州電力公司和四國電力公司對核電的依賴程度都超過了40%。如果，日本的核電站全部停止運營，那麼日本西部的供電缺口將超過日本全國缺電的平均數。本來還想用節餘電力支援災區的日本西部有可能變成日本最大的重災區，日本經濟遭到打擊的程度可想而知。菅的核電政策雖然獲得了不少政治得分，但卻使日本經濟陷入更加困難的境地。
福島核電站事故引起了日本大面積缺電，而社會輿論的導向也使核電站沒有新建的可能，緩解供電不足只能使用成本更高的其他替代能源，日本的能源價格的上漲已經無法避免。而大面積缺電和能源價格上漲有將使日本經濟在供給方面受到限制。日本經濟已經因為生產能力的多餘而需求不足形成了長期的滯脹，勞動人口已經開始減少，曾經非常高的儲蓄率也會很快地變成負數，已經是0.5%以下的經濟增長率將毫無疑問地再次歸零。也就是說，隨著日本核電站的全部停止運營，日本將告別富裕的時代。
日本學者早就對日本經濟的走向做過以上的預警，事實上日本經濟的這種傾向在3月份大地震發生之前就早已顯露端倪。但是日本政府卻沒有開出很好的處方，實際上日本政府也沒有很多選擇餘地，唯一可行的措施是增稅。但是任何一個政黨提出增稅的政策，就會在全國的大選中遭到慘敗。本來，這次大地震可以給日本重振經濟的一次機會，但是菅首相的核電政策將這次脆弱的機會也斷送了。
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