在南港展覽館、龍潭購地案方面，陳水扁強調重大財經事項不屬於“總統”職權，並且他非常“因應時事”，以馬英九關心人民買不買得到台鐵車票為例，表示他當時身為“總統”，當然會關心重大財經相關事務推動，但誰能說買火車票是“總統”職權？
陳水扁更表示，他對南港展覽館、龍潭購地案的款項完全不知情，指出被告余政憲、李界木、蔡銘哲等人的說法也前後不一，且他們都只提到他的妻子吳淑珍，完全沒提到他。陳水扁說，不能因為關心政府施政，就被視為利用職權收賄，他因此被起訴，實在令他“欲哭無淚”。
對於陳水扁辯稱財經政策推動非“總統”職權，林嚞慧也反駁說，民國93年10月，陳水扁在“總統”經濟顧問小組曾提及二次金改跟兩兆三星計劃，並公開向媒體表示，如有公務員執行不力就馬上撤換，顯示“總統”職權可影響重要的經濟議題。
林嚞慧還表示，陳水扁雖然沒有開口跟台泥董事長辜成允要求新台幣4億元，但他利用“總統”高度向“行政院”內部施壓，使得原本被行政部門反對的龍潭購地案最後還是獲准。
林嚞慧說，“國家”花100億元購買土地，公務員卻在背後收取佣金，而4億元佣金中的600萬美元，被告利用親友間帳戶層層轉匯鉅款，就是在隱匿不法所得及典型的湮滅證據。
而在洗錢案方面，陳水扁說，他在“國務機要費”、龍潭購地、南港展覽館三案都沒有犯罪，就無犯罪所得，僅在今年年初經由妻子吳淑珍告知，才知道有海外資產被凍結。而他匯給“總統府”資政吳澧培的200萬美金，的確是用做推動外交之用。
檢方在庭上也證實過去傳言，指出陳水扁家中未被查扣的5.7億的確是不法所得，和企業有關，而這5.7億當中有2億是由元大馬家併復華金所付的賄款。
檢方指出2006年6月陳水扁指示親信林德訓向蔡鎮宇要求協助，搬走國泰世華總行裡近8億現金，遭到蔡鎮宇拒絕，於是陳水扁由吳淑珍找來杜麗萍、吳景茂、陳俊英，還有高中同學吳文清搬離8億現金其中至少有7億4千萬，藏到國內某企業家的保管室。
檢方續指出特偵組在起訴前依法查扣1億7千萬，另有5億7千萬匯到海外，更何況陳水扁在今年初，接到葉盛茂的告知後，馬上把留存在阿萬杜帳戶的賄款，迅速轉出並結清，就是要湮滅證據，如果不將陳水扁羈押，下落不明的5.7億元可能又會遭陳水扁搬移，湮滅證據。
另外審判長蔡守針對“國務費”詢問陳水扁，法官問到機密外交是否為真，扁回答並無南線專案，只是為了掩飾更重大的機密外交案子，法官也問及為何當時“國務費案”時將發票全改列極機密，使得辦案困難，扁回應是因律師建議。
在羈押庭尾聲，蔡守訓問扁律師，“如果不押你，你覺得有有哪種強制處分，可以確保審理程序進行？”扁律師則回應指出，被告畢竟是執政8年的“總統”，當然最希望維持無保釋放，審判長再問“如果具保呢，你們金額要多少？”律師表示從偵查開始，被告所有的財產已被凍結，包括所以被告事實上若提出鉅額的保釋金是有困難的，只能請庭上斟酌有無羈押必要。
對於陳水扁在檢方論告後答辯指出，關於5.7億元下落，妻子吳淑珍早在本月18日就請兒子陳致中、媳婦黃睿靚向特偵組詳細交代，但特偵組卻無回應，林嚞惠則表示，陳致中夫婦於97年12月18日具狀，願將5.7億流向進行說明。陳致中終於鬆口這些錢的下落，的確有可能是不法所得，不是像陳水扁之前一直說的，這些錢是選舉的結餘款。
然陳致中願意將瑞士的錢匯回台灣，也願意說出5.7億的下落，但認罪協商必須在審理中才能進行，而陳致中認罪協商，也間接證實了特偵組始終查不出來的5.7億，自認是人頭的陳致中，相當清楚錢藏在哪，這份認罪協商，成了檢方在法庭攻防最後一刻祭出的押箱寶。 |
