第二個問題是，隱身結構能否適應上艦結構改裝。
現階段，隱身戰機獲得隱身性能，主要依靠隱身外形與隱身塗層。這兩者除了要保證技術的可靠性之外，更重要的一點是，必須保證外形上的平整。眾所周知，艦載機出於節省甲板、機庫面積的考慮，其主翼均採用折叠結構，有些艦載機甚至在水平尾翼上也採用了類似結構。因此，從隱身的角度上講，能否保證由主翼折叠結構而造成的巨大縫隙能夠在飛行中完全閉合，就成為考量隱形艦載戰機能否保持其隱身性能的重要標準。為應對此類開口，目前均採用鋸齒型結構，希望借此折射雷達波，但將該結構應用到長達數米的主翼折叠接縫上，無疑存在巨大技術考驗。因此，傳統的平直接縫結構仍將被延續，但如何解決由此引發的與隱身結構上的衝突，將成為衡量隱形戰機能否上艦的又一個重要標準。
第三個問題是，隱身戰機能否適應傳統裝備環境。
眾所周知，儘管“隱形戰機”幾乎已經成為第四代戰機的統稱，但對第四代戰機而言，“隱身性能”僅僅是其獲得戰術優勢的組成部分之一。包括超音速巡航能力在內的其他性能，不僅使其戰力較之傳統裝備獲得了明顯提升，也使其裝備、使用環境，相比傳統裝備產生了明顯差別。但問題在於，就目前的情況看，任何一個在研第四代戰機的國家，均沒有能力在短時間內以第四代戰機全面替換傳統裝備。因此，至少在未來的航母上，必然出現新老裝備混裝的現象，作為飛行平台與智慧中樞的航母，也不可能因部分全新戰機的到來，而全面升級、改變其原有設備。這無疑將導致與數量更加眾多的傳統裝備之間的溝通障礙。目前，第四代戰機在這方面確實存在嚴重瓶頸。F-22在試驗過程中，曾出現戰機間根本無法通話、戰機與預警機之間無法進行作戰信息交流、戰機與地面指揮機構難以進行信息互換等嚴重的兼容性問題。因此，第四代戰機的艦載型，能否在相對傳統的環境中，與傳統的裝備以及裝備環境達成兼容，將極大影響隱形戰機的艦載型正常發揮其應有戰力。
儘管目前尚無證據顯示，中國將為其未來國產航母裝備隱身艦載機，但作為新興的航母國家，客觀需求與技術發展決定了中國必然將為自己的航母配備此類裝備。相比之下，似乎在航母與隱形戰機方面走得更早更遠的美國更具優勢，但事實並非如此。中國得益於自身在重型隱身艦載機方面的裝備理念、技術特點與發展方式上的優勢，或將取得對美國類似裝備的非對稱優勢。
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