蔣渭水先生利用上述這四個組織，以其飽滿的熱情與智慧，全身心地領導台灣人民從事非武裝抗爭活動，捍衛民族尊嚴，引領台灣文化啟蒙運動，影響了台灣整整數代人。他10多次入獄坐牢，積勞成疾。
1931年8月5日，蔣渭水因罹患大腸傷寒症病逝於台北。遺體移往三板橋火葬場火化，當日大雨滂沱，蒼天都為之悲痛落淚！
8月23日出殯，依然大雨傾盆，日本警察嚴密戒備，仍有5000多民眾冒雨為蔣渭水送行。台灣媒體報道說，當天有從南京等地發來的上百件吊慰電文，在音樂隊、靈車等車隊的簇擁下，民眾手執白幡送蔣渭水最後一程，“移靈時突然下起大雨，送葬民眾無人退避，在台灣喪禮歷史上，堪稱空前絕後。”
當時蔣渭水遺體安葬於大直山公墓，後因台灣被日本軍國主義拖入戰爭泥潭，大直公墓被強征為日軍要塞，蔣渭水的遺骨被迫遷移到關渡慈航寺。1952年，蔣渭水的昔日同志牽頭募款，才把他的遺骨遷葬至六張犁芳蘭山上，長眠於此已經有51年矣。
對於台灣歷史上如此重要的人物，台灣當局在很長時間裡卻相當忽視。這種不正常的情況，直到近些年來才有所改觀。
2005年馬英九擔任中國國民黨主席時，曾經把台灣先賢的巨幅畫像安放在中央黨部的外墻上，以表尊崇和紀念，更為激勵後人不要忘記歷史。首先安放的就是蔣渭水、李友邦等人的畫像，一時間曾引起轟動。
2006年，台北市政府選在當年蔣渭水活動過的地點附近，將原來的錦西公園更名為“蔣渭水紀念公園”，並設置入口意象方碑及紀念牌樓各一座。當時的台北市長馬英九親自撰寫紀念碑文。
據台灣“中央社”2011年5月19日報道，台北市文化局長謝小韞曾會同辛晚教、黃富三等4名“文化資產審議委員會”委員，19日上午專程前往六張犁蔣渭水墓園會勘。辛晚教委員表示，蔣渭水墓園相當具有象徵意義，屆時一定會根據全世界文化資產的標準包括歷史、文化、藝術等方面進行評估。他說，未來也希望能夠更加提升墓園的周邊環境並恢復歷史意象。
同年8月5日，馬英九在出席“蔣渭水先生逝世80周年紀念會”致辭時表示，“文建會”打算將位於宜蘭（蔣渭水家鄉）傳統藝術中心的演藝廳，命名為“蔣渭水紀念廳”，希望能盡速在2011年10月“台灣文化協會”成立90周年時揭牌；長遠的構想則希望在條件成熟時，建置“蔣渭水紀念館”。
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