部署審計“兩統籌”。十八屆四中全會報告提出審計監督全覆蓋後，審計任務進一步加重，2019年初召開的全國審計工作會議對“兩統籌”作出部署，要求加強審計項目和審計組織方式統籌。同年，審計署發布《關於做好審計項目審計組織方式“兩統籌”有關工作的通知》，明確了“兩統籌”有關工作的具體措施。作為審計管理模式的重大創新，審計“兩統籌”要求利用預算執行審計、政策落實跟蹤審計、經濟責任審計三大平台統籌相關審計工作，一定程度上優化了審計資源配置，提升了審計效能，減輕了被審計單位的負擔，減少了重複審計，增強了審計全覆蓋的質量。
推進審計法制建設。中央全面深化改革委員會重視審計法制建設，十三五期間國家發布了一系列與審計法制相關的文件制度。2015發布《開展領導幹部自然資源資產離任審計試點方案》《關於完善審計制度若干重大問題的框架意見》，對審計業務創新和審計體制改革提出了頂層設計；2017年發布《關於深化國有企業和國有資本審計的若干意見》《自然資源資產離任審計規定（試行）》，2019年7月發布《黨政主要領導幹部和國有企事業單位主要領導人員經濟責任審計規定》，對審計工作產生了重大影響。2019年《審計法》徵求意見稿向社會公布，拉開了審計法第二次修訂的帷幕。審計署發布《審計署關於內部審計工作規定》《審計署關於加強內部審計工作業務指導和監督的意見》，國資委發布《關於深化中央企業內部審計監督工作的實施意見》，為提升審計監督合力奠定了基礎。中央軍委修訂發布《軍隊審計條例》，出台《關於加強新時代軍隊審計工作的意見》，明確了軍隊審計體制，軍隊審計法制化建設取得重大突破。
堅持科技強審。審計機關堅持科技強審，以信息化建設推動新時代審計事業發展。2017年，審計署按照“統一規劃，兩級部署，以用為主”的建設要求，全面開啟金審工程三期建設，並指導地方審計機關同步配套實施。2019年，已完成金審三期五大應用系統19個子系統的建設工作，實現審計署本級應用系統全面上線試運行。近年來，審計機關加強非現場大數據審計應用，全面推廣“總體分析、發現疑點、分散核實、系統研究”的數字化審計方式，大大提升了審計效率，促進了審計監督全覆蓋。
強化審計機關隊伍建設。十三五期間，審計機關扎實開展“兩學一做”“不忘初心，牢記使命”主題教育，提高政治站位，提升審計人員的審計職業責任感和使命感，堅持“以審計精神立身”。審計機關不斷 “抓規範、求創新、促發展”，通過創新和規範雙輪驅動，志在“以創新規範立業”。審計署開設審計大講堂，擴大了審計人員視野；審計署黨校和幹部教育學院結合審計項目和機關隊伍建設，舉辦不同層級和各業務領域的培訓班研討班；審計署及時出台審計“四嚴禁”工作要求，設立相關機構，形成內容協調、程序嚴密、配備完備、有效管用的巡視制度體系；完善特約審計員制度，加強審計機關自身監督，努力“以自身建設立信”。
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