其次，“一邊一國連線”在兩岸路線上的偏激主張，替兩岸和平發展及互信基礎，平添許多變數，台灣是否會因為一邊一國過於亢奮與激進而受害？恐怕仍值得後續觀察。
再者，“一邊一國連線”的實力及裹脅民進黨的力量不容小覷，此次民進黨在五都選舉雖然將其定位為“地方治理”之戰，避談統獨，但日後黨中央在“一邊一國連線”等深綠台獨人士的裹脅之下，勢必難以迴避兩岸議題，這對民進黨企圖往中間移動，無疑是一大障礙。
對於台灣內部，一路挺扁的“一邊一國連線”召集人王定宇日前表示，五都選舉中“一邊一國連線”所有34位議員及幾位挺扁“立委”，將齊聚台南，集思廣益討論救扁行動，進一步凝聚共識。而扁辦已決定籌組救扁小組積極向海外求援，其中主要先向美國發聲，救扁小組將讓國際社會理解扁案的法律爭議、不公平及違憲之處，因此，會先把法律爭議翻譯成英文，讓國際媒體理解案情全貌，進而理解他不是貪污“總統”，扁案是一件政治判決。
“一邊一國連線”的諸多動作，勢必又會惹來台灣政壇上的漣漪，首先陳水扁究竟是政治犯還是司法犯，答案非常清楚；其次陳水扁本人所有的訴訟上權利及一切合法程序，並沒有漏掉；再者國外倘若認為“阿扁”是對的，那麼從瑞士及海外所掀起的證據又該如何看待？至於民進黨發言人林右昌則表示，民進黨對於救扁小組並不清楚，顯然民進黨中央與“一邊一國連線”保持若即若離的態度。
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