東京訴訟案的原告于2002年12月提起訴訟，控辯雙方的主要爭議點在於：(1)日本政府是否對在華遺孤問題的發生負有責任；(2)是否違反了讓遺孤早日返回日本的義務；(3)是否盡到幫助遺孤在回到日本後實現自立的義務。
審判長加藤謙一認為，“產生在華遺孤的直接原因是前蘇聯士兵、當地居民的犯罪行為，日本的殖民地政策及戰爭政策不屬於司法審查物件。遺孤們共同遭受的傷害是無法與日本的雙親一起生活，沒有將日語作為母語使用的能力，但其原因並非國家的違法行為”。
此外，對於日本政府是否有義務讓遺孤早日返回日本一事，加藤謙一稱沒有憲法、國際法或條約、法令的根據，他還指出，“1972年日中實現邦交正常化時，距離在華遺孤問題發生已過了26年多，對他們造成的傷害已經發生。日本政府已盡可能接受了遺孤，對此應予以肯定。如果遺孤一次性地大量返回日本，勢必會造成混亂”。
至於國家對遺孤返回日本後實現生活自立的支援問題，加藤謙一表示，“我知道原告抱有不滿，但是政府對此並無法律義務，只是出於人道主義進行支援。而且歸國遺孤可以享受生活保護，因此不能認定遺孤受到了不容忽視的傷害，不能說政府有何違法或不當行為”。
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