第一次於2004～2005年，爲試掘階段。在遺址的海灘高潮綫附近布設了兩個的小探方T1和T2，規格是1×1.5m，深度掘至0.6m左右；在遺址的中部基岩石墻之下方，試掘了兩個探方T3和T4，兩方相連呈探槽狀，以下統稱爲T3T4，順山坡東西長5m，南北寬1m，最深處2.0m；在距遺址中心南東向約40 m的一處山坡，試掘了一個探方T5，長寬各2.0m，深0.8m；另外在T5周圍進行了採樣鑽的探採，共有4個鑽孔，距T5探方東、南、西 北各5m。另外，還發現了一處古采石場Q1，未來得及清理。

　　第二次於2005～2006年，爲正式發掘。在T3T4上方南側一處較爲平坦的坡地，正式布方15個，呈棋盤狀，發掘了其中的T6、T7、T8、T14、T17、T20。由於經費拮據，僅T14探方掘到基岩的風化層，其他各探方均未掘到底。另外，清理了遺址上方基岩石墻下的一處陡壁，據判斷爲另一處古采石場Q2，布設清理方QT1。

　　這些考古工程較爲清楚地揭露了遺址的第四紀地層。

　　一、探方所揭示的地層

　　T1，T2探方

　　位於黄地峒海灘潮間帶的T1和T2探方所揭示的地層剖面，均爲海潮搬運的冲積物直接覆蓋在凝灰岩基岩的風化層之上。

　　據T1、T2探方剖面可見，海灘上的冲積物的成分較雜，有大小不一的石塊、粗砂、貝殻和廢棄的現代遺物如玻璃、塑料製品等。L1和L2層的海灘礫石中多見有人爲加工過的石製品，包括手斧、石核、石片等。底層L3爲海洋冲積物，以中粗砂和礫石爲主，含白色粘土，未見石製品。因下層已接近基岩的風化殘積層，同時低於海平面，地下涌水，未能向深處挖掘。

　　T5探方

　　T5位於遺址南部的山坡處，探方掘深不到1m已到基岩凝灰岩的風化層。周邊的探孔到基岩最深也只有1.2 m左右，均未見任何文化遺物，該處的地層關係較爲簡單。

　　T5探方的坡積層L1和L2厚約0.3m，爲紅色砂質粘土，下部L3爲凝灰岩的風化殘積層，厚度不詳，有較多硅質凝灰岩角礫石。

　　第一次試掘的T3、T4探方和第二次發掘的T14探方均挖到基岩風化層，挖掘最深度2.0 m左右，揭露的地層較全，可依此詳細分析黄地峒遺址的第四紀地層。

　　T3T4探方

　　T3和T4爲相連的兩個探方，南北寬1.0 m，東西總長度5.0 m，傾角27°，形成一條沿山坡的探槽。地層可分爲6層，其中，底層L6爲凝灰岩的風化層，L1～L5層爲第四紀坡積層。   

　　T3T4－L1，海拔高度10.53～8.35 m，層厚0.04～0.15 m。坡積物除礫石外，爲深灰色（dark gray 10YR4/1)（粘土土色英文名稱及編號根據《Munsell Soil Color Charts》，Munsell Color，Gmretag Macbeth Year 2000 Revised，下同）礫砂質粘土。含較多樹根草根及碳化的腐殖質。以粘土爲主，約占90 ％，細砂約占10 ％。礫石中混有較多尖角狀碎石、石片和石制半成品。

　　T3T4－L2，海拔高度10.42～8.31 m、層厚0.06～0.35 m。坡積物除礫石外，爲深灰褐色（dark grayish brown 10YR4/2)砂質粘土。粘土含量較上層少，含砂量約10 ％。層中含碎石較多，夾大量石塊，石塊多爲稜角狀。

　　T3T4－L3，海拔高度10.06～8.22 m、層厚0.06～0.29 m。坡積物除礫石外，爲淺灰色（light gray 10YR7/2) 含砂粘土。坡積物除礫石外，粘土約占95%，細砂約占5 ％，結構鬆散，局部石塊之間可見大的空隙。層中含較多岩塊和石製品，石製品岩性均爲硅質凝灰岩。岩塊亦以硅質凝灰岩爲主，多呈稜角狀。

　　T3T4－L4，海拔高度9.77～8.22 m、層厚0.12～0.40 m。坡積物除礫石外，爲黄色（yellow 10YR7/6）粘土，含砂量極少，可塑性較强。含少量石料及大量凝灰岩風化後殘留的礫石、中礫和巨礫，小礫石直徑在0.2 cm至6 cm，中礫的直徑在6 cm至20 cm，巨礫直徑在20 cm以上。出土石料和石器稍少，以石片石器爲主，原料爲硅質凝灰岩，表面呈白色，有一層較厚的“石皮”。

　　T3T4－L5，海拔高度9.37～8.49 m、層厚0.11～0.71 m。坡積物除礫石外，爲深黄色（yellow 10YR7/8）粘土。土質黏性較L4更强，顔色較L4深。含風化的凝灰岩礫石，中礫和巨礫更多，體積更大。出土少量石料，石製品中石片爲常見，石器不多。原料亦爲硅質凝灰岩，表面爲白色，“石皮”風化嚴重，用手搓之，有粉塵剥落。

　　T3T4－L6，除礫石外，爲黄色粘土。含較多的表層風化和微風化的凝灰岩中礫和巨礫。發掘厚度0.10～1.20 m，此層爲基岩風化殻，不含任何石製品。所以未繼續向下挖掘。

　　T14探方

　　T14探方距T3T4探方東南方1.0 m處，位置較T3T4探方稍高，更接近山坡上基岩露頭處，地形較爲平坦。

　　T14所揭示的地層與T3T4基本一致，坡積層較T3T4薄，近現代坡積層L1直接覆在L3層之上，L2層局部缺失，僅西北角處仍有保留，L4層與L5層界綫不明顯，統定爲L4。

　　T14－L1，砂壤土，深灰色（10YR 4/1)，厚10～15 cm，含大量腐殖質及草根。地層内有少量角礫塊、石片、廢片，爲近現代坡積層，同T3T4－L1層。

　　T14－L2，砂質粘土，灰褐色（10YR 4/3)，厚25 cm，只出現在探方西北角，含大量腐殖質和草根，同T3T4－L2層。地層内有少量角礫塊、石片、廢片。

　　T14－L3，含砂粘土，淺灰－黄色（10YR 7/6)，厚15～25 cm，含大量角礫塊、石片、廢片、碎屑，有少量石器，同T3T4－L3層的岩性相似，便埋藏深度只相當於T3T4的L2下部，石製品基本呈水平分佈。

　　T14L4，含砂粘土，黄褐色（10YR 7/8)，厚10～50 cm，地層上部内有大量角礫塊、石片、廢片和少量石器。從埋藏的深度，此層相當於T3T4的L3下部和4的上部，本探方中没有明顯的分層界綫，故未細分。只分爲上、中、下三層，地層中的石製品基本呈水平分佈。

　　T14L6，基岩，爲深度風化的凝灰岩。此層相當於T3T4的L6層，不含石製品。凝灰岩中的長石類礦物已被淋濾，僅剩石英顆粒，岩石外表十分像風化的砂岩，結構鬆散，可以挖掘，因受鐵質浸染呈橙紅色，局部見鐵錳質結核。角礫石表面的風化層厚達30mm，成粉末狀。

　　二、采石場南壁堆積剖面

　　黄地峒遺址山坡上方爲一處基岩風化殘留的岩墻，距T6探方東23 m，海拔高度爲32 m，地理坐標N832655，E847325。岩墻南北長13.5 m，東西寬3.0 m，垂直高度4.8 m。走向爲345°～165°，傾角65°。岩性基本爲硅質凝灰岩，局部含燧石。岩墻被大量碎石和雜草覆蓋，清理後，發現一處古采石場，定爲第二號采石場Q2，清理方爲QT1。

　　QT1－L1，坡積層，以土壤、砂和石屑、石塊組成。土質爲深灰色（10YR 5/2) 砂壤土，含草根、樹根等。坡積物中粗砂和碎石占70%以上，碎石具明顯稜角狀，部分石塊有人爲打擊痕迹，可定爲石製品。

　　 QT1－L2，坡積層，中粗砂和角礫石爲主，含大量石製品的廢片、碎屑。角礫礫石多呈片狀，受地表逕流的水動力作用，形成順層定向排列。石片長20～50 mm，厚10～24 mm，長邊呈水平狀排列。石片均呈稜角狀。夾層爲棕黄色（10YR 8/6)砂質土。

　　QT1－L3，坡積層，棕灰色（7.5YR 5/3)砂質土，砂粒顆粒較上層稍細。層中有大量角礫石和少量石片。礫石排列無序。

　　QT1－L4，坡積層，棕黄色（10YR 7/ 6) 砂質土，砂粒顆粒較細。有大量角礫石和石片、廢片和石製品碎屑，排列無序，塊徑不一。

　　QT1－L5，碎石堆積層，含水量淺褐色 （7.5YR 6/3)細砂質土。所含碎石角礫直徑小，多在5cm以下。富集極爲密集的石片、廢片、石製品碎屑，排列無序。

　　QT1－L6，基岩，岩性爲硅質凝灰岩，表面披上一層風化層，厚約2 mm，呈灰白色，打擊後的新鮮面爲灰黑色。岩層傾向75°，傾角38°。可見沿層面向深部掘進的人工痕迹，形成采石坑。

　　在第二號采石場的東南側約85 m處，亦有基岩岩墻出露，2004年試掘時發現。海拔高度40～50 m，地理坐標N832650、E847330。岩墻北西－南東長25.0 m，寬約4.0 m，垂直高度約5.0 m。岩性爲硅質凝灰岩，地表發現大量作爲打制石器原料的岩塊，定爲第一號采石場Q1，尚未進行清理。